Titre : |
Reexamination of the molecular phylogeny of the masu salmon in the genus oncorhynchus : *** |
Autre titre : |
Reévaluation de la position phylogénétique du saumon masou dans le genre Oncorhynchus |
Auteurs : |
Oohara, Ichiro%Sawano, Keiichi%Okazaki, ToshioSeret, B.%Sire, J.Y.-, |
Editeur : |
Société Française d'Ichtyologie |
Année de publication : |
1999 |
Importance : |
p. 417-426 |
Format : |
24 cm |
Note générale : |
GENIE GENETIQUE |
Catégories : |
SCIENCES DE LA VIE
|
Mots-clés : |
MAGA%PHYLIP%MODELE F 84%MODELE TAMURA NEI%ARBRE PHYLOGENETIQUE SALMONOIDEI%ONCORHYNCHUS MASOU%EVOLUTION%ADN%MITOCHONDRIE%SEQUENCE NUCLEIQUE |
Résumé : |
Pour réprécier la position phylogénétique du saumon masou dans le genre Oncorhynchus, une séquence d'ADN mitochondrial de 2162 paires de bases a été analysée pour 8 espèces de Salmonidae du gène pour la sous unité 6 de l'ATPase et la région 5' du gène pour la sous unité 4L de la NADH deshydrogénase. Les distances génétiques entre ces neuf espèces ont été calculées par la méthode de Tamura Nei pour les positions du troisième codon des régions codantes. Deux arbres phylogénétiques ont été obtenus par la méthode du neighbor joining et du maximum de vraisemblance.- Les phylogénies obtenues suggèrent que le saumon masou aurait été le premier à diverger d'un ancêtre commun au genre Oncorhynchus bien que cette branche ne soit pas supportée par une valeur de bootstrap très forte. Les deux méthodes de construction d'arbres utilisées ici tenant compte du fort biais de composition nucléotidique observé dans les gènes mitochondriaux des salmonidés, les arbres obtenus sont plus fiables que ceux qui ont été précédemment publiés sur la base du modèle de Kimura à deux paramètres ou utilisant une méthode de parcimonie (Résumé d'auteur)- - |
Note de contenu : |
- - - - - - |
Numéro du document : |
04B |
Niveau Bibliographique : |
2 |
Indicateur Bibliographique : |
K |
Bull1 (Theme principale) : |
GENIE GENETIQUE |
Reexamination of the molecular phylogeny of the masu salmon in the genus oncorhynchus : *** ; Reévaluation de la position phylogénétique du saumon masou dans le genre Oncorhynchus [] / Oohara, Ichiro%Sawano, Keiichi%Okazaki, ToshioSeret, B.%Sire, J.Y.-, . - Société Française d'Ichtyologie, 1999 . - p. 417-426 ; 24 cm. GENIE GENETIQUE
Catégories : |
SCIENCES DE LA VIE
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Mots-clés : |
MAGA%PHYLIP%MODELE F 84%MODELE TAMURA NEI%ARBRE PHYLOGENETIQUE SALMONOIDEI%ONCORHYNCHUS MASOU%EVOLUTION%ADN%MITOCHONDRIE%SEQUENCE NUCLEIQUE |
Résumé : |
Pour réprécier la position phylogénétique du saumon masou dans le genre Oncorhynchus, une séquence d'ADN mitochondrial de 2162 paires de bases a été analysée pour 8 espèces de Salmonidae du gène pour la sous unité 6 de l'ATPase et la région 5' du gène pour la sous unité 4L de la NADH deshydrogénase. Les distances génétiques entre ces neuf espèces ont été calculées par la méthode de Tamura Nei pour les positions du troisième codon des régions codantes. Deux arbres phylogénétiques ont été obtenus par la méthode du neighbor joining et du maximum de vraisemblance.- Les phylogénies obtenues suggèrent que le saumon masou aurait été le premier à diverger d'un ancêtre commun au genre Oncorhynchus bien que cette branche ne soit pas supportée par une valeur de bootstrap très forte. Les deux méthodes de construction d'arbres utilisées ici tenant compte du fort biais de composition nucléotidique observé dans les gènes mitochondriaux des salmonidés, les arbres obtenus sont plus fiables que ceux qui ont été précédemment publiés sur la base du modèle de Kimura à deux paramètres ou utilisant une méthode de parcimonie (Résumé d'auteur)- - |
Note de contenu : |
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Numéro du document : |
04B |
Niveau Bibliographique : |
2 |
Indicateur Bibliographique : |
K |
Bull1 (Theme principale) : |
GENIE GENETIQUE |
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